Comisión de Garantías. Es el órgano supremo de control de las medidas disciplinarias internas, tanto de carácter individual sobre los afiliados y afiliadas como de carácter colectivo sobre las organizaciones. Interviene además en cuantas reclamaciones le presenta la afiliación o las organizaciones integradas en la Unión sindical, sobre violación de los principios de democracia interna reconocidos en los Estatutos.

Desde nuestro 9º Congreso está compuesta por:

- Jesús Aguinaga Tellería
- Antonio Agesta Peñuela
- Juan Antonio Castillo

Suplentes:

- Iñaki Fernández de Aranguiz Baleztena
- Miguel Angel Beriain Arbeloa

Comisión de Control Administrativo y Financiero. Su función es la de controlar el funcionamiento administrativo y financiero de los órganos de la Unión Sindical de CCOO de Navarra.

Desde nuestro 9º Congreso está compuesta por:

- Alberto Amescoa Díaz
- Lorena Rodríguez Benito
- Carmen Nagore Domaica

Suplentes:

- Miguel Arnedo Lana
- José Luís Alcalde Robledo.